Kungliga Tekniska högskolan,

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, historia och filosofi.

Avdelningsinformation

Positionen kommer formellt att vara placerad vid avdelningen för Computational Science and Technology (CST) at KTH, men det praktiska arbetet kommer att utföras vid Science for Life Laboratory. CST bedriver datavetenskaplig forskning och modellering inom biologiska och fysiska system. Detta kräver effektiva och avancerade algoritmer samt bildanalyssystem. För mer information över pågående arbeten, se https://www.kth.se/en/csc/forskning/cst. SciLifeLab är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. Vårt mål är också att bygga en stark forskargruppering kring SciLifeLab genom utbildning och samverkan. SciLifeLab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Vi samarbetar med flera andra svenska universitet. För mer information, besök https://www.scilifelab.se/.

Arbetsuppgifter

Vi söker en doktor med ett stort intresse för implementering och anpassning av bildanalysalgoritmer för kvantitativ analys av mikroskopdata för att ansluta sig till SciLifeLab BIIF. Du kommer att arbeta på korta och långsiktiga projekt, tillhandahålla forskningsstöd och utbildning om bildanalys. BIIF har knutpunkter i både Uppsala och Stockholm, men uppdraget omfattar även tjänster till forskare vid andra universitet i Sverige. Arbetet omfattar deltagande och organisation av kurser och workshops i digital bildbehandling och analys med livsvetenskapliga applikationer. Handledning av masterprovstudenter ingår i uppdraget. 20% tid kommer att användas till stöd för projekt på LCI-anläggningen i Huddinge.

Kvalifikationer

En doktorsexamen i databasanalys / bildbehandling, eller doktorsexamen i biomedicin / biologi (eller motsvarande), kombinerat med dokumenterad erfarenhet av datorprogrammering och utveckling av digitala bildanalyslösningar krävs.
Dessutom anses följande kvalifikationer vara mycket önskvärda:

  • Erfarenhet av algoritmutveckling och utveckling av analyspipeliner som syftar till att kvantifiera och klassificera biologiska parametrar extraherade från mikroskopiedata eller t.ex. celler och mikroorganismer i kulturer och vävnadsprover
  • Erfarenhet av medicinsk bildanalys
  • Erfarenhet av analysprogramvara som Imaris, ImageJ / Fiji, CellProfiler, NIS och Amira
  • Erfarenhet av undervisning och studentövervakning - Kunskap med ett vetenskapligt programmeringsspråk (Python, R, eller Matlab)
  • Utmärkt engelsk kommunikationsförmåga, både talat och skrivet, liksom utmärkta interpersonella färdigheter

Andra meriterande erfarenheter och färdigheter

  • Postdoktoral erfarenhet inom bildanalys, inom eller utanför akademin, speciellt inriktad på metodutveckling
  • Kännedom om djupa inlärningsramar som Keras, TensFlow eller PyTorch

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida

Ansökan

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in. Din kompletta ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista dagen för ansökningsperioden.

Ansökan ska innehålla följande handlingar:
1. Uppgift om intresse, inklusive en kort beskrivning av erfarenheterna av bioimage analysis
2. Curriculum vitae
3. Referenskontaktinformation
4. Representativa publikationer (eller annat exempel på vetenskapligt skrivande) Observera att allt material skall vara på engelska förutom officiella dokument.

Övrigt

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Enligt överenskommelse
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Stockholm
Län Stockholms län
Land Sverige
Referensnummer D-2017-0987
Kontakt
  • Kevin Smith / Assistant Professor, ksmith@kth.se
  • Maria Engman / HR-administratör, maengm@kth.se
Publicerat 2018-01-18
Sista ansökningsdag 2018-02-28

Tillbaka till lediga jobb